اثر جایگزینی رزیدوی موقعیت 91 اکورین با متناظرش در نمیوپسین، روی ساختار و عملکرد آن: پیشنهاد نحوهی قرارگیری کلنترازین در ساختار نمیوپسین

فتوپروتئینهای وابسته به یون کلسیم از دو خانواده کتنوفور (شانه داران) و کلنترات (کیسه تنان) با وجود تشابه ساختاری بالا، میزان تشابه آمینواسیدی بسیار پایینی دارند. در فتوپروتئینهای کلنترات، حفره اتصال به کلنترازین شدیداً آبگریز و دور از دسترس حلال است و اگرچه هیچ آمینواسید بارداری دیده نمیشود، حضور یک باقیمانده دارای بار مثبت، یعنی آرژنین 39 (در نمیوپسین)، در این حفره در فتوپروتئینهای کتنوفور بسیار جلب توجه میکند. جهش یافته r39k نمیوپسین نسبت به فرم طبیعی بیش از 9 برابر افزایش فعالیت نشان میدهد، به علاوه این جهش یافته افزایش توأم فعالیت و پایداری را به همراه داشته است. بنابراین، این موقعیت در کتنوفورها نه تنها تنظیم کننده فعالیت است، بلکه موقعیتی کلیدی در پایداری این فتوپروتئینها نیز محسوب میشود. در این تحقیق به بررسی نقش رزیدوی موقعیت 19 اکورین، موقعیت متناظر r39 در نمیوپسین پرداخته شد. با توجه اندک تغییرات فعالیت جهش یافته های m19k و m19r اکورین میتوان بیان کرد که این دو جایگاه از نظر تکاملی اگرچه در تطبیق توالی متناظراند اما در ساختار و عملکرد، نقشهای متفاوتی دارند. با انجام داکینگ کلنترازین با نمیوپسین مشاهده شد که احتمالا کروموفور در حفره ی نمیوپسین بسیار متفاوت از اکورین قرار میگیرد. به منظور تأیید آن، جهش d156n انجام شد که منجر به کاهش چشمگیر فعالیت نمیوپسین گردید.